Générateurs de génome?

• Mai 4, 2024

Il y a seize ans, le monde a rencontré le premier mammifère cloné: Dolly le mouton. Au-delà de l’étonnement ou de la peur qui étaient à l’origine, obtenir des informations dans Biologie moléculaire Il s'est accéléré à un rythme impressionnant grâce au développement de nouvelles technologies, plus efficaces, plus rapides et plus accessibles.

Cela pose un inconvénient: comment analyser et comprendre tout ce monde de données et d'informations pour détecter et résoudre les problèmes biologiques? À l'ère de la construction du génome, les chercheurs associent les avancées en sciences génomiques et des machines informatiques pour créer des bases de données d'informations biologiques dans un livre électronique.

Spécialistes en génomique computationnelle de la Centre des sciences génomiques de l'UNAM guider d'autres scientifiques dans les profondeurs de la nature d'un organisme. Sa mission est d'assister les chercheurs dans l'étude des gènes et des génomes, ainsi que dans la modélisation et la prévision de concepts de biologie, tels que le comportement d'une cellule.

Une des plus grandes réalisations de l'équipe, dirigée par le médecin Julio Collado Vides , était d’obtenir la séquence complète du génome de la bactérie Escherichia colli, contribution publiée en 1997 dans la revue Science , l’un des plus reconnus du monde scientifique. À ce jour, le projet central du groupe est l'édition du livre électronique sur la physiologie de cette bactérie et d'autres.

La génomique est l'étude de la totalité des propriétés du génome: structure, interaction et fonctions de ses composants. Le génome est le matériel génétique d'un organisme et contient toutes les informations nécessaires à la création et au développement de cet être et au transfert de ses caractéristiques de génération en génération.

Les connaissances issues des sciences génomiques grandissent de jour en jour. Environ 500 articles scientifiques par an sont produits autour d’Escherichia colli. "C'est l'organisme le plus connu au niveau moléculaire. De là est née la biologie moléculaire ", explique le scientifique universitaire.

Le groupe de génomique computationnelle examine et conserve les données saisies dans la littérature scientifique, qui seront ensuite interprétées par d'autres chercheurs.

"Nous sommes des conservateurs, nous lisons des articles et extrayons des preuves et des découvertes, en codant toutes ces informations dans une structure informatique nous permettant de représenter les éléments de la cellule et leurs interactions", souligne Julio Collado.

D'autres scientifiques sont chargés de comprendre la signification de ces données et de tirer des conclusions, telles qu'expliquer pourquoi les humains et les mouches sont si différents si leur génome coïncide à 60%; ou pourquoi plusieurs membres d'une famille développent certains types de cancers.

Face à ce panorama, Collado Vides se demande quel est le destin de la bactérie Escherichia colli, en tant que sous-ensemble de connaissances biologiques pouvant contribuer à la génomique du futur. "Nous connaissons tellement de choses sur un seul organisme que le défi consiste à intégrer toutes les connaissances générées par les scientifiques pour représenter la complexité biologique."

Grâce à l'infrastructure de premier niveau du groupe de génomique computationnelle, ses membres développent des méthodes de prévision des réseaux de régulation, des facteurs de transcription et des associations fonctionnelles entre gènes.

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